Рыская по бесконечным просторам сверхсети, наткнулся на весьма любопытную бактерию Mycoplasma Henitalium. Простите мне мой латинский. Казалось бы, чем может заинтересовать аскетичного исследователя бактерия со столь говорящим названием? А между тем свойства этого организма приводят к совершенно закономерному интересу. Научному, разумеется.
Патогенные свойства бактерии, заставляющие известные места воспаляться, обеспечивают им первоначальное пристальное внимание людей в белых халатах и резиновых перчатках. Паразитический характер организма обеспечил ему шанс на относительную простоту организации, чем он и воспользовался. Его геном насчитывает всего 582970 пар оснований и до 2002 года науке не было известно более простой бактерии. Простота в свою очередь приводит к возможности изучить вредителя во всей полноте, что очень привлекательно.
В 2008 году группе биологов удалось с нуля собрать ДНК этой бактерии, что являлось безусловным прорывом.
И самое, на мой взгляд, впечатляющее достижение, связанное c Mycoplasma Henitalium — это работа группы исследователей из Стэнфордского университета. Объединив знания из более, чем 900 научных работ, посвящённых бактерии, они создали её полную компьютерную модель для изучения на молекулярном уровне.
Сайт проекта: http://www.wholecell.org/
Исходники, преимущественно на matlab, можно глянуть на github
Чтобы погонять модель, скорее всего придётся собрать кластер на GNU/Linux, похожий на тот, что использовался в проекте.
Патогенные свойства бактерии, заставляющие известные места воспаляться, обеспечивают им первоначальное пристальное внимание людей в белых халатах и резиновых перчатках. Паразитический характер организма обеспечил ему шанс на относительную простоту организации, чем он и воспользовался. Его геном насчитывает всего 582970 пар оснований и до 2002 года науке не было известно более простой бактерии. Простота в свою очередь приводит к возможности изучить вредителя во всей полноте, что очень привлекательно.
В 2008 году группе биологов удалось с нуля собрать ДНК этой бактерии, что являлось безусловным прорывом.
И самое, на мой взгляд, впечатляющее достижение, связанное c Mycoplasma Henitalium — это работа группы исследователей из Стэнфордского университета. Объединив знания из более, чем 900 научных работ, посвящённых бактерии, они создали её полную компьютерную модель для изучения на молекулярном уровне.
Сайт проекта: http://www.wholecell.org/
Исходники, преимущественно на matlab, можно глянуть на github
Чтобы погонять модель, скорее всего придётся собрать кластер на GNU/Linux, похожий на тот, что использовался в проекте.
Комментариев нет:
Отправить комментарий